Ο αυτοκινητόδρομος της Εγνατίας Οδού (Α2) περνάει νότια της πόλης και έχει δυο εξόδους για αυτήν, την ανατολική και την δυτική έξοδο.
H Εθνική οδός ενώνει την Κομοτηνή με την Θεσσαλονίκη από την μια και την Αλεξανδρούπολη από την άλλη.
Υπάρχει επίσης ο κάθετος άξονας της Εγνατίας Οδού στην ανατολική έξοδο της πόλης , που συνδέει την Εγνατία με τα ελληνοβουλγαρικά σύνορα στο πρώην τελωνείο της Μακάζας .
Η Κομοτηνή απέχει 247 χλμ από την Θεσσαλονίκη και 746 χλμ από την Αθήνα.
Με το αεροπλάνο
Η Κομοτηνή εξυπηρετείτε από δυο αεροδρόμια, με πλησιέστερο τον αερολιμένα Δημόκριτο της Αλεξανδρούπολης με απόσταση 65χλμ από την πόλη και εναλλακτικά από τον αερολιμένα Μέγας Αλέξανδρος στην Χρυσούπολη της Καβάλας που απέχει 80 χλμ.
Αερολιμένας Δημόκριτος: τηλ 2551089314
Αερολιμένας Μέγας Αλέξανδρος τηλ: 2591053409
Με το λεωφορείο
Το Κτελ Κομοτηνής έχει δρομολόγια από και προς Αθήνα, Θεσσαλονίκη, Ξάνθη, Καβάλα, Αλεξανδρούπολη και Σέρρες.